Пет база су аденин, гванин, цитозин, тимин и урацил, који имају симболе А, Г, Ц, Т, и У, респективно. Назив базе се углавном користи као назив нуклеотида, мада је то технички нетачно. База се комбинује са шећером како би се створили нуклеотиди аденозин, гванозин, цитидин, тимидин и уридин.
Нуклеотиди су именовани на основу броја остатака фосфата који садрже. На пример, нуклеотид који има аденинску базу и три фосфатна остатка назвао би се аденосин трифосфат (АТП). Ако нуклеотид има два фосфата, то би био аденозин дифосфат (АДП). Ако постоји појединачни фосфат, нуклеотид је аденозин монофосфат (АМП).
Иако већина људи научи само пет главних врста нуклеотида, постоје и други, укључујући нпр. циклички нуклеотиди (нпр. 3'-5'-циклични ГМП и циклични АМП.) База се такође може метилирати тако да формирају различите молекули.
И једно и друго ДНК и РНА користите четири базе, али не користе исте исте. ДНК користи аденин, тимин, гванин и цитозин, док РНА користи аденин, гванин и цитозин, али уместо тимина има урацил. Спирала молекула формира се када две комплементарне базе формирају водоничне везе једна са другом. Аденин се веже са тимином (А-Т) у ДНК и са урацилом у РНА (А-У). Гуанин и цитозин се међусобно допуњују (Г-Ц).
Да бисте формирали нуклеотид, база се повезује са првим или примарним угљеником рибозе или деоксирибозом. Угљен шећера број 5 повезује се са кисеоником фосфатне групе. У молекулама ДНК или РНК, фосфат из једног нуклеотида формира фосфодиестерску везу са угљеником број 3 у следећем нуклеотидном шећеру.
Хемијска формула аденина је Ц5Х5Н5. Аденин (А) се везује за тимин (Т) или урацил (У). Важна је база јер се користи не само у ДНК и РНК, већ и у енергетском носачу молекул АТП, кофактор флавин аденин динуклеотид и кофактор никотинамид аденин динуклеотид (НАД).
Иако су људи склони да нуклеотиде називају по базама, аденин и аденозин нису исте ствари. Аденин је назив базе пурина. Аденозин је већи молекул нуклеотида сачињен од аденина, рибозе или деоксирибозе и једне или више фосфатних група.
Хемијска формула пурина гванина је Ц5Х5Н5О. Гванин (Г) се везује само за цитозин (Ц), и у ДНК и у РНА.
Цитозин се може спонтано променити у урацил. Ако мутација није поправљена, то може оставити остатак урацила у ДНК.
Урацил је слаба киселина која има хемијску формулу Ц4Х4Н2О2. Урацил (У) се налази у РНА, где се веже са аденом (А). Урацил је деметилирани облик основног тимина. Молекул се рециклира кроз скуп реакција фосфорибосилтрансферазе.