Катастрофалне поплаве на Иеллов Ривер опрали усјеве, утопили сељане и променили ток реке тако да се више није сусрела са Гранд каналом. Гладни преживели ових катастрофа почели су мислити да су њихови етнички-монголски владари, Династија Иуан, изгубила Мандат неба. Када су ти исти владари присилили 150.000 до 200.000 својих кинеских поданика да искажу масивну радну трупу да ископе канал још једном и придруже га реци, радници су се побунили. Овај устанак, назван побуном Црвеног Турбана, наговештавао је почетак краја владавине Монгола над Кином.
Први вођа Црвених турбана, Хан Схантонг, регрутовао је своје следбенике из присилних радника који су 1351. ископавали корито канала. Ханов дјед био је вођа секте Белог лотоса, која је пружала верске основе за побуну Црвеног Турбана. Власти династије Иуан убрзо су ухватиле и погубиле Хан Схантонг, али његов син је заузео његово место на челу побуне. Оба Ханс-а су била способна да играју против глади својих следбеника, јер су били незадовољни због тога што су били присиљени да раде без плаће за владу и њихову дубоку невољкост да владају "варвари" из Монголија На северу Кине, то је довело до експлозије антивладине активности Црвеног турбана.
У међувремену, на југу Кине почео је други устанак у Црвеном Турбану под вођством Ксу Схоухуи-а. Имао је сличне притужбе и циљеве као и северни Црвени турбани, али ова двојица нису ни на који начин координирана.
Иако су сељачки војници првобитно идентифицирани са бијелом бојом (из Друштва бијелих лотоса), убрзо су прешли на много сретнију црвену боју. Да би се идентификовали, носили су црвене траке за главу или хонг јин, што је побуни дало назив „Црвена турбанска побуна“. Наоружани импровизованим оружјем и сеоским алатима, они нису требали бити стварна пријетња армијама централне владе под водством Монгола, али династија Иуан је била у немир.
У почетку, способни заповједник звани Главни савјетник Тогхто успио је сакупити ефикасну силу од 100.000 царских војника који би одложили сјеверне Црвене турбане. Успео је у 1352. години, усмеривши Ханову војску. Црвени Турбани су 1354. године поново кренули у офанзиву пресекавши Велики канал. Тогхто је окупио силу која је традиционално бројала милион, мада је то без сумње велико претјеривање. Тек што је почео да се креће против Црвених турбана, дворска сплетка резултирала је да је цар отпустио Тогхто. Његови су огорчени официри и многи војници напустили протест у знак протеста због уклањања, а јуански суд никада није могао да нађе другог ефикасног генерала који би водио напоре против Црвеног турбана.
Током касних 1350-тих и почетка 1360-их, локални вође Црвених турбана борили су се између себе за контролу војника и територије. Потрошили су толико енергије једни за друге да је Иуан влада једно време оставила у релативном миру. Изгледало је као да би се побуна могла срушити под тежином амбиција различитих ратних ратника.
Међутим, син Хан Схантонг умро је 1366; неки историчари верују да га је генерал Зху Иуанзханг утопио. Иако су биле потребне још две године, Зху је водио своју сељачку војску да заузме монголску престоницу у Даду (Пекинг) 1368. године. Династија Иуан је пала, а Зху је основао нову, етнички хану Кинези династија названа Минг.