ТБЕ и ТАЕ користе се као пуфери у молекуларној биологији, превасходно за електрофореза нуклеинских киселина. Трис пуфери се користе у мало базичним пХ условима, као и за електрофорезу ДНК, јер се тако одржава ДНК растворљив у раствору и депротониран тако да ће га привући позитивна електрода и мигрирати кроз а гел. ЕДТА је састојак у раствору, јер је ово уобичајено хелатно средство штити нуклеинске киселине од разградње ензимима. ЕДТА хелира двовалентне катионе који су кофактори за нуклеазе које могу контаминирати узорак. Међутим, пошто је кацијум магнезијума кофактор ДНК полимеразе и рестрикционих ензима, концентрација ЕДТА се наменски држи ниском (концентрација око 1 мМ).
Не морате да стерилишите раствор. Иако се падавине могу појавити након дужег времена, основни раствор је и даље употребљив. ПХ можете подесити помоћу пХ метра и додавањем концентрованог додавања кап по кап хлороводонична киселина (ХЦл). У реду је складиштити ТБЕ пуфер на собној температури, мада бисте можда желели да филтрирате основни раствор кроз филтер од 0,22 микрона да бисте уклонили честице које би подстакле таложење.
Коришћење 5Кс или 10Кс основног решења случајно ће вам дати лоше резултате јер ће се произвести што више топлоте. Осим што вам даје лошу резолуцију, узорак се може оштетити.
Иако су ТБЕ и ТАЕ уобичајени пуфер за електрофорезу, постоје друге опције за проводљиве растворе са ниском моларношћу, укључујући литијум боратни пуфер и пуфер натријум бората. Проблем са ТБЕ и ТАЕ је у томе што пуфери на бази Трис-а ограничавају електрично поље које се може користити у електрофорези јер превише набоја изазива одбеглу температуру.