Захваљујући технологији која је научницима данас доступна, постоји много начина да се теорија еволуције поткријепи доказима. Сличности са ДНК између врста, знање о развојна биологијаи других доказа за микроеволуцију има у изобиљу, али научници нису увек имали могућности да испитују ове врсте доказа. Па како су подржали еволуцијску теорију пре ових открића?
Научници су подржали то Теорија еволуције током историје је користећи анатомске сличности између организама. Показујући како делови тела једне врсте личе на делове тела друге врсте, као и накупљање адаптација док структуре на сличним врстама не постану сличне, неки су начини еволуције поткријепљени анатомским доказима. Наравно, увек се нађу трагови давно изумрлих организама који такође могу дати добру слику о томе како се врста мењала током времена.
Трагови живота из прошлости називају се фосили. Како фосили пружају доказе у прилог теорији еволуције? Кости, зуби, шкољке, отисци или чак у потпуности сачувани организми могу сликати живот какав је живот био у временским периодима од давних времена. Не само да нам даје трагове о организмима који су дуго изумрли, већ може показати и посредне облике врста док су подвргнути спецификацији.
Научници могу користити информације са фосила да би поставили прелазне форме на право место. Они могу користити релативно датирање и радиометријско или апсолутно датирање како би открили старост фосила. Ово може помоћи да се попуне празнине у знању како се врста мењала из једног временског периода у други токомГеолошка временска лествица.
Иако неки противници еволуције кажу да је запис о фосилима заправо доказ еволуције, јер у запису о фосилима постоје „нестале везе“, то не значи да је еволуција неистинита. Фосиле је веома тешко створити и околности морају бити баш такве да би мртви или распадајући организам могао постати фосил. Највероватније постоји такође много неоткривених фосила који би могли да попуне неке празнине.
Ако је циљ утврдити колико су двије врсте повезане с филогенетским стаблом живота, тада треба испитати хомологне структуре. Као што је горе поменуто, морски пси и делфини нису у блиској вези. Међутим, делфини и људи јесу. Један доказ који подупире идеју да делфини и људи потичу од заједничког претка јесу њихови удови.
Делфини имају предње пераје које помажу у смањењу трења у води док пливају. Међутим, гледајући кости унутар лептира, лако је видети колико је грађевина слична људској руци. Ово је један од начина на који научници класификују организме у филогенетске групе које се одвајају од заједничког претка.
Иако дупин и ајкула изгледају врло слично облику тела, величини, боји и положају пераја, они нису уско повезани са филогенетским дрветом живота. Делфини су заправо много ближе човјеку него морски пси. Па зашто они изгледају толико слично ако нису у сродству?
Одговор лежи у еволуцији. Врсте се прилагођавају свом окружењу како би попуниле празну нишу. Будући да морски пси и делфини живе у води у сличним климама и областима, имају слично ниша што треба да испуни нешто у тој области. Неповезане врсте које живе у сличном окружењу и имају исту врсту одговорности у својим екосуставима и имају тенденцију да акумулирају прилагодбе које се додају да би личиле једна на другу.
Ове врсте аналогних структура не доказују да су врсте повезане, већ их подржавају Теорија еволуције показује како врсте граде прилагодбе да би се уклопиле у своје окружења. То је покретачка снага спецификације или промене врсте током времена. Ово је, по дефиницији, биолошка еволуција.
Неки делови у организму или на њему више немају видљиву употребу. То су остаци из претходног облика врсте прије него што је дошло до спецификације. Чини се да је врста нагомилала неколико прилагодби због којих додатни део више није био користан. Временом је део престао да функционише, али није у потпуности нестао.
Више корисни делови се називају вестигијалне структуре, а људи имају неколико њих, укључујући и краљежницу која нема реп повезан са њим и орган зван додатак који нема очигледну функцију и може бити уклоњен. У неком тренутку током еволуције, ови делови тела више нису били потребни за опстанак и они су нестали или престали да функционишу. Вестигијалне структуре су попут фосила унутар организма који дају трагове прошлим облицима врсте.