Водене заједнице су главна водена станишта на свету. Као копнени биоми, водене заједнице се такође могу поделити на основу заједничких карактеристика. Две заједничке ознаке су слатководне и морске заједнице.
Слатководне заједнице
Ријеке и потоци су водена тијела која се непрекидно крећу у једном смјеру. Обе заједнице се брзо мењају. Извор реке или потока се обично знатно разликује од места на коме се река или ток празни. Разне биљке и животиње могу се наћи у овим слатководним заједницама, укључујући пастрмку, алге, цијанобактерије, гљивицеи, наравно, разне врсте риба.
Естуарији су подручја где се потоци слатке воде или реке сусрећу са океаном. Ове високо продуктивне регије садрже веома разнолик биљни и животињски живот. Река или поток обично носи много храњивих састојака из унутрашњих извора, чинећи ушћа способним да подрже ову богату разноликост и високу продуктивност. Естуарији се хране и узгајају разне животиње, укључујући водопаде, гмизавци, сисарии водоземаца.
Језера и језерци су водена тијела. Многи потоци и реке завршавају у језерима и барама. Фитопланктон се обично налази у горњим слојевима. Пошто се светлост апсорбује само до одређених дубина,
фотосинтеза је уобичајена само у горњим слојевима. Језера и рибњаци такође подржавају разне биљне и животињске врсте, укључујући ситне рибе, слане козице, водене инсекте и бројне биљне врсте.Морске заједнице
Океани покривају око 70% земљине површине. Морске заједнице је тешко поделити на различите типове, али се могу класификовати на основу степена продора светлости. Најједноставнија класификација састоји се од две различите зоне: фотички и афотичан зоне. Фотичка зона је зона светлости или површина од површине воде до дубина на којима је интензитет светлости само око један проценат интензитета на површини. У овој се зони догађа фотосинтеза. Велика већина морског живота постоји у фотичкој зони. Афотична зона је подручје које прима мало или нимало сунчеве светлости. Околина у овој зони је изузетно мрачна и хладна. Организми који живе у афотској зони често су биолуминесцентни или су екстремофили и вешти у животу у екстремним окружењима. Као и код других заједница, у океану живи низ организама. Неки укључују гљивице, сунђере, Морска звезда, морске анемоне, рибе, ракови, динофлагелати, зелене алге, морски сисарии џиновске алге.