Пречишћавање баластне воде најновијом технологијом може испунити стандарде брзином од 2500 кубика (660,430 галона) на сат. Великом броду ће и даље требати неколико сати по размени да би се на овај начин испразнио њени баластни резервоари.
Прва, размена баластне воде, заснива се на одређеним удаљеностима и дубинама на којима се неко пловило може испразнити.
Неке области уводе стандарде који превазилазе смернице ИМО-а. И Калифорнија и регион Великих језера у Сједињеним Државама усвојили су строге локалне смернице. САД је једна од многих главних бродских држава које нису потписале конвенцију.
У случају размјене баластне воде, бродски оператери избацују необрађен баласт из спремника. Ово је практичан, ако не и савршен начин за омогућавање рада старијих бродова без трошка и логистичких проблема ретрофитинга за прераду баластне воде.
Нова и преуређена пловила имају много мање вероватноће да превозе нежељене врсте због баластне воде системи за третирање раније уклањају велики део одрживих организама из баластних резервоара пражњење.
Вода третирана према овом стандарду сматра се довољно чистом да се испушта у већини лука. Ови кораци за поновно посредовање баластне воде ефикасни су само у уклањању нежељених организама. Још је могуће преношење токсина попут бакра и тешких метала који се често налазе у лукама до других одредишта у баластној води и ти загађивачи се могу концентрисати у седименту баластних резервоара. Радиоактивне материје се такође могу транспортовати у баласту, али било какви озбиљни случајеви ће вероватно брзо пронаћи особље за надгледање.